В целях совершенствования мер борьбы с инфекциями, управляемыми средствами специфической профилактики, в республике систематически внедряются новые вакцины, рекомендованные ВОЗ:
С 2007г. внедрена вакцинация против кори, эпидемического паротита и краснухи.
С марта 2009 года в республике внедрена 3-х кратная вакцинация новой комбинированной пентавалентной (АКДС+ВГВ+ХИБ) вакциной детям в возрасте 2-3-4 месяцев.
В середине 2013 году планируется внедрение 2-х кратной вакцинации ротавирусной вакциной детям в возрасте 2 и 3 месяцев.
Благодаря приложенным усилиям, в стране удалось достигнуть высокого охвата вакцинацией против управляемых инфекций и спокойной эпидемической ситуации. В течение последних десяти лет охват профилактическими прививками в республике против основных инфекций колеблется в пределах от 95% и выше. Охват профилактическими прививками против инфекций включенных, в календарный план прививок за 10 месяцев 2012 года составил, от 99,1% до 99,7%.
В связи с осложнившейся эпидемической ситуацией по полиомиелиту в Таджикистане, со стороны Министерства здравоохранения Республики Узбекистан при помощи с ВОЗ, ЮНИСЕФ в 2010г были проведены НДИ против полиомиелита. Проведены 4 раунда среди детей в возрасте 0-5 лет и до 25 лет в Сурхандарьинской области. В апреле и мае 2011 и 2012 гг. были проведены НДИ по 2 раунда оральной полиомиелитной вакциной. Всего было охвачено 8-ю раундамии 12,3 млн. человек и охват составил 98-99%.
В республике с 1997 года проводится постоянный эпидемиологический надзор за острыми вялыми параличами (ОВП) среди детей до 15 лет. Из года в год на должном уровне поддерживаются показатели эпидемиологического надзора за ОВП, рекомендованные ВОЗ. Всего за 2011г зарегистрировано 200 случаев ОВП и за 10 месяцев 2012 года 196 случаев ОВП.
Усилен активный эпидемиологический надзор за ОВП с еженедельным представлением отчётов в Министерство здравоохранения. Согласно рекомендациям ВОЗ, основной индикаторный показатель качества проводимого эпидемиологического надзора с 2011 года увеличен с 1 до 2 случаев ОВП на 100 тыс. населения в возрасте до 15 лет. Однако, несмотря не неоднократные факсограммы и напоминания, все еще имеются «молчащие зоны» по мониторингу и регистрации случаев ОВП. Так, по Республике Каракалпакстан «молчащими зонами» являются 6 из 16 городов и районов. В Андижанской, Джизакской, Кашкадарьинской, Сырдарьинской и Хорезмской областях имеется от 1 до 2 «молчащих зон». Это свидетельствует о низком качестве проводимого активного эпидемиологического надзора за ОПВ, что является недопустимым, учитывая неблагополучную ситуацию по полиомиелиту в приграничных с Узбекистаном территориях (Таджикистан, Афганистан), а также высокую миграцию населения между странами (Российская Федерация).
В 8 областях республики с 20 по 25 мая 2013 года проведены национальные дни иммунизации против полиомиелита.
Всемирная неделя иммунизации, которая будет проведена 24-30 апреля, откроет возможности для того, чтобы подчеркнуть значение иммунизации для спасения человеческих жизней и настоятельно рекомендовать семьям вакцинировать детей против смертоносных болезней
Иммунизация населения против полиомиелита проводится в 8 приграничных областях и районах Республики Узбекистан в 2 раунда 22-27 апреля и 20-25 мая 2013года.